結局XnViewの最新版1.96使ってます。
バックグラウンドで、少しでも重い処理が走ってると、XnViewの動作がかなり遅くなる模様。
今回の場合は、バックでWMVエンコードをやってました。

それでもフォルダ数が多いと若干遅い気もします。
ですが、それを差し引いても色々便利なので、今後も使う予定です。
もう少しでコスプレとかファッション写真のカテゴリ分けが終わりそうです。

便利機能としては、
多彩なファイルへの対応（psdとか動画もok）
カテゴリ別に分けて表示できること
他形式への一括変換
リサイズや画像補正を一括で行えること
EXIF情報による画像回転が可能

など、他にもたぶん使いこなしてない便利機能がありそうです。